MSYS je kolekcia GNU utilít, ako sú bash, make, gawk a grep, ktoré umožňujú vytváranie aplikácií a programov, ktoré závisia od tradične používaných nástrojov UNIX.Je určený na doplnenie MinGW a nedostatkov cmd obalu.Príkladom by bolo vytvorenie knižnice, ktorá používa systém vytvárania autotoolov.Používatelia zvyčajne spustia „./configure“ a potom „make“, aby ho zostavili.Skript pre konfiguráciu shellu vyžaduje interpret skriptu, ktorý nie je prítomný v systémoch Windows, ale poskytuje ho MSYS ....